SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

Fatores que influenciam a transformação genética de milho (Zea mays L.) via Agrobacterium tumefaciens.

ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; MORO, G. V.; KIRSCHNIK, L. N. G..

A produção de peixes nativos e seus híbridos chama a atenção daqueles que observam o Brasil como alvo de investimentos agropecuários e futura potência da aquicultura mundial. Dada a competitividade e dinamismo, o mercado aquícola nacional tem motivado a produção de híbridos em maior escala nos últimos anos, buscando neles características favoráveis de ganho de peso, resistência ao frio, rusticidade e adaptação à alimentação artificial. Por outro lado, a mistura de animais híbridos sobre as linhagens puras e o seu escape inadvertido para os ambientes naturais certamente expõe a sustentabilidade da aquicultura. Sendo assim, este documento buscou reunir informações sobre a produção, impacto genético, riscos e desafios do cultivo de híbridos frente ao desafio...

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Peixe; Genética; Conservação; Biodiversidade.

Ano: 2014

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1008360

ALVES, M. de C.; OLIVEIRA, R. P. de; CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A..

Desde o primeiro relato de transformação de milho por A. tumefaciens, vários fatores que influenciam a transferência do T-DNA e a regeneração de células transgênicas em cultura de tecidos têm sido investigados e aprimorados. O propósito deste documento é apresentar uma breve revisão literária do processo de infecção de células vegetais pela Agrobacterium tumefaciens que culminam com a transferência do T-DNA da bactéria para células da planta. Além disso, discutir alguns dos fatores que influenciam este processo na transformação do milho e que devem ser considerados durante o desenvolvimento de protocolos de transformação genética via Agrobacterium.

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Melhoramento genético vegetal; Milho; Bactéria.

Ano: 2015

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1037777

Estudo de parâmetros que influenciam a transformação genética de milho (Zea mays L.) HiII via Agrobacterium tumefaciens.

ALVES, M. de C.; OLIVEIRA, R. P. de; OLIVEIRA, K. H. de; CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A..

A transformação genética de milho pode ser utilizada para o desenvolvimento de cultivares mais produtivas e adaptadas a diversos estresses ambientais. Existem vários métodos para a modificação genética do milho, sendo que, atualmente, um dos mais utilizados é a transformação via Agrobacterium tumefaciens. Esta metodologia apresenta vantagens como uma maior precisão na integração do T-DNA, um menor número de cópias do transgene inseridas no genoma da planta, poucos rearranjamentos das moléculas de DNA introduzidas e uma maior estabilidade fenotípica durante muitas gerações de cruzamento. Em contrapartida, é um método genótipodependente e recalcitrante em monocotiledôneas. O objetivo deste...

Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Melhoramento genético; Análise histoquímica; Cocultivo; Embrião imaturo.; Tecido vegetal; Histologia vegetal; Bactéria; Infecção..

Ano: 2016

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1052193

Resistência de genótipos de cupuaçuzeiro a Lasiodiplodia theobromae.

ALVES, R. M.; BENCHIMOL, R. L.; OLIVEIRA, R. P. de; CHAVES, S. F. da S..

Esta pesquisa teve por objetivo avaliar a resistência genética de 16 clones de cupuaçuzeiro a Lasiodiplodia theobromae. O estudo foi realizado em duas quadras localizadas no município de Tomé Açu, Nordeste do Pará. A primeira foi plantada com mudas enxertadas de base, no arranjo de Sistema Agroflorestal (SAF) com bananeira e taperebazeiro. Na segunda, a pleno sol, foi empregada a técnica de substituição de copa para a formação das plantas. As avaliações foram realizadas quando as plantas da primeira e da segunda quadra estavam com 10 e 22 anos, respectivamente. Em cada quadra, os 16 tratamentos comuns estavam representados por aproximadamente 20 plantas. Foram estimados o índice de plantas sadias e a influência

Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Cupuaçu; Theobroma Grandiflorum; Lasiodiplodia Theobromae; Doença de Planta; Doença Fúngica; Resistência Genética; Variação Genética.

Ano: 2018

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1100895

Avaliação da produção e estimativa de parâmetros genéticos em genótipos de girassol no Nordeste do Estado do Pará.

Analise dos processsos de quebra, sintese e reparo do DNA durante a profase meiotica em Lilium spp.

ALVES, R. M.; EL-HUSNY, J. C.; RIBEIRO, A. da S.; BASTOS, A. J. R..

Esta pesquisa teve por objetivo promover a avaliação final de dois ensaios de girassol instalados no Nordeste do Estado do Pará e estimar parâmetros genéticos para auxiliar na seleção dos genótipos. Os experimentos foram conduzidos em campo, no Município de Paragominas, PA, na safra de 2016. No Ensaio Final de Primeiro Ano (EF01) foram avaliados nove genótipos de girassol, em delineamento experimental de blocos casualizados, com quatro repetições. Cinco genótipos tiveram bom comportamento produtivo no local do estudo e são passíveis de seleção. No segundo experimento, Ensaio Final de Segundo Ano (EF02), foram testados seis genótipos em delineamento idêntico ao do experimento anterior. Entretanto, o comportamento produtivo médio dos genótipos foi inferior...

Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Paragominas; Girassol; Planta oleaginosa; Genótipo; Melhoramento genético vegetal; Genetically modified plants.

Ano: 2017

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1070419

ALVES, R. M.; NASCIMENTO FILHO, F. J. do.

Trabalho como parte do Curso de Pos-Graduacao em Genetica e Melhoramento de Planta (LGN-809 Genetica Molecular).

Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Lillium; Brasil; Sao Paulo; Piracicaba; Species; Plants; Nucleotide sequence; DNA; Espécie; Meiose; Planta.

Ano: 1984

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/670465

Linkage analysis between dominant and co-dominant makers in full-sib families of out-breeding species

Alves,Alexandre Alonso; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião; Alfenas,Acelino Couto.

As high-throughput genomic tools, such as the DNA microarray platform, have lead to the development of novel genotyping procedures, such as Diversity Arrays Technology (DArT) and Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), it is likely that, in the future, high density linkage maps will be constructed from both dominant and co-dominant markers. Recently, a strictly genetic approach was described for estimating recombination frequency (r) between co-dominant markers in full-sib families. The complete set of maximum likelihood estimators for r in full-sib families was almost obtained, but unfortunately, one particular configuration involving dominant markers, segregating in a 3:1 ratio and co-dominant markers, was not considered. Here we add nine further...

Joint analysis of phenotypic and molecular diversity provides new insights on the genetic variability of the brazilian physic nut germplasm bank

Palavras-chave: Statistical genomics; Exogamic populations; Recombination frequency and maximum likelihood.

Ano: 2010

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000300021

Alves,Alexandre Alonso; Bhering,Leonardo Lopes; Rosado,Tatiana Barbosa; Laviola,Bruno Galvêas; Formighieri,Eduardo Fernandes; Cruz,Cosme Damião.

The genetic variability of the Brazilian physic nut (Jatropha curcas) germplasm bank (117 accessions) was assessed using a combination of phenotypic and molecular data. The joint dissimilarity matrix showed moderate correlation with the original matrices of phenotypic and molecular data. However, the correlation between the phenotypic dissimilarity matrix and the genotypic dissimilarity matrix was low. This finding indicated that molecular markers (RAPD and SSR) did not adequately sample the genomic regions that were relevant for phenotypic differentiation of the accessions. The dissimilarity values of the joint dissimilarity matrix were used to measure phenotypic + molecular diversity. This diversity varied from 0 to 1.29 among the 117 accessions, with an...

Herança da resistência do acesso de melancia PI 595201 a isolado de PRSV-W do Estado do Tocantins

Palavras-chave: Molecular variability; Jatropha curcas L.; Phenotypic variability.

Ano: 2013

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000300012

Bragantia

Alves,Anatércia Ferreira; Nascimento,Ildon Rodrigues do; Ticona-Benavente,César Augusto; Faria,Marcos Ventura; Sarmento,Renato de Almeida; Figueira,Antônia dos Reis; Maluf,Wilson Roberto.

Com o objetivo de identificar o tipo de herança, o número de genes e os parâmetros genéticos e fenotípicos da resistência do acesso PI 595201 a um isolado de PRSV-W da região Norte do Brasil foi conduzido um experimento na área experimental do Departamento de Produção Vegetal da Universidade Federal do Tocantins, em condições de casa de vegetação. A partir do cruzamento entre a cultivar suscetível Crimson Sweet (P1) e o acesso resistente PI 595201 (P2) foi obtida a geração F1 e as gerações segregantes, cujas plantas foram inoculadas e avaliadas quanto à resistência com base nos sintomas nas folhas. Foram avaliadas 48, 48, 80, 200, 100 e 100 plantas das gerações P1, P2, F1, F2, RC11 e RC12, respectivamente, em delineamento inteiramente casualizado com...

Supernumerary chromosomes in the pufferfish Sphoeroides spengleri: first occurrence in marine Teleostean Tetraodontiformes fish

Palavras-chave: Citrulus lanatus var. lanatus; Potyvirus; Resistência genética; Componentes principais.

Ano: 2014

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052014000200007

Alves,Anderson Luis; Porto-Foresti,Fábio; Oliveira,Claudio; Foresti,Fausto.

Cytogenetic analyses carried out in eight specimens of Sphoeroides spengleri revealed the presence of 2n = 46 chromosomes (20 M/SM and 26 ST/A). Besides the standard karyotypical set, the presence of B microchromosomes was observed in two individuals, ranging from 0 to 2 microchromosomes per cell. A karyotype composed by 2n = 46 chromosomes with occurrence of M and SM chromosomes is considered basal for the species from the clade comprising the families Tetraodontidae, Balistidae, and Diodontidae, although it represents a derived condition for the order Tetraodontiformes, whose basal karyotype would be composed by 2n = 48 acrocentric chromosomes. The occurrence of B microchromosomes in marine Tetraodontiformes fish was not known, and this represents the...

Divergência genética de milho transgênico em relação à produtividade de grãos e à qualidade nutricional

Palavras-chave: B chromosome; Pufferfish; Sphoeroides spengleri.

Ano: 2008

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572008000200014

Ciência Rural

Alves,Bruna Mendonça; Filho,Alberto Cargnelutti; Burin,Cláudia; Toebe,Marcos; Silva,Leila Picolli da.

O objetivo deste trabalho foi verificar a divergência genética entre genótipos de milho transgênico, em relação à produtividade de grãos e à qualidade nutricional. O experimento foi conduzido na safra 2009/2010, em Santa Maria, Estado do Rio Grande do Sul, no delineamento blocos casualizados, com três repetições. Foram avaliados 18 genótipos e mensuradas as seguintes variáveis após a colheita: produtividade de grãos, proteína bruta, lisina, metionina, cisteina, treonina, triptofano, valina, isoleucina, leucina, fenilalanina, histidina, arginina, extrato etéreo, amido e amilose. Para cada variável, foi realizada a análise de variância e comparadas as médias por meio do teste de Scott-Knott. Foi determinada a matriz de...

Interferon lambda 4 (IFNL4) gene polymorphism is associated with spontaneous clearance of HCV in HIV-1 positive patients

Palavras-chave: Zea mays L. variabilidade genética; Análise de agrupamento.

Ano: 2015

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015000500884

Alves,Camila Fernanda da Silveira; Grott,Camila Schultz; Lunge,Vagner Ricardo; Béria,Jorge Umberto; Tietzmann,Daniela Cardoso; Stein,Airton Tetelbom; Simon,Daniel.

Abstract Approximately one-third of the individuals infected with human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) are co-infected with hepatitis C virus (HCV). Co-infected patients have an increased risk for developing end-stage liver diseases. Variants upstream of the IFNL3 gene have been associated with spontaneous and treatment-induced clearance of HCV infection. Recently, a novel polymorphism was discovered, denoted IFNL4 ΔG > TT (rs368234815), which seems to be a better predictor of spontaneous clearance than the IFNL4 rs12979860 polymorphism. We aimed to determine the prevalence of the IFNL4 ΔG > TT variants and to evaluate the association with spontaneous clearance of HCV infection in Brazilian HIV-1 patients. The IFNL4 ΔG > TT genotypes were...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/other

Palavras-chave: IFNL4 genotypes; HIV/HCV co-infected patients; Spontaneous clearance.

Ano: 2016

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572016000300374

5S rDNA characterization in twelve Sciaenidae fish species (Teleostei, Perciformes): depicting gene diversity and molecular markers

Alves-Costa,Fernanda A.; Martins,Cesar; Matos,Fernanda Del Campos de; Foresti,Fausto; Oliveira,Claudio; Wasko,Adriane P..

In order to extend the genetic data on the Sciaenidae fish family, the present study had the purpose to characterize PCR-generated 5S rDNA repeats of twelve species of this group through PAGE (Polyacrylamide Gel Electrophoresis) analysis. The results showed the occurrence of at least two different 5S rDNA size classes in all the species. Moreover, 5S rDNA repeats of one of the studied species - Isopisthus parvipinnis - were cloned and subjected to nucleotide sequencing and Southern blot membrane hybridization analyses, which permitted to confirm the existence of two major 5S rDNA classes. Phylogenetic analysis based on the nucleotide sequences of different 5S rDNA repeats of I. parvipinnis lead to their separation into two major clusters. These results may...

Herdabilidade e correlações genotípicas entre caracteres de folhagem e sistema radicular em famílias de cenoura, cultivar Brasília

Palavras-chave: Sciaenidae; Fish; Isopisthus parvipinnis; 5S rDNA; Molecular markers.

Ano: 2008

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572008000200025

Horticultura Brasileira

Alves,José Carlos da S; Peixoto,José Ricardo; Vieira,Jairo V; Boiteux,Leonardo S.

O presente trabalho foi implementado com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para os seguintes caracteres de importância para o melhoramento genético da cenoura: número de folhas por planta (NFP), comprimento da maior folha na planta (CF), comprimento da raiz (CR), peso da raiz (PR), diâmetro da raiz (DR) e diâmetro do xilema (DX). Este experimento foi conduzido em condições de campo durante o verão de 1999/2000, sendo utilizadas 69 famílias de meios-irmãos derivadas da cultivar Brasília. As progênies foram cultivadas em delineamento de blocos ao acaso com duas repetições e parcelas de 2 m², com quatro linhas de 20 plantas cada. Os valores observados para coeficiente de variação genética oscilaram de 4,8 a 10,9. Os...

Chromosome characterization and variability in some Iridaceae from Northeastern Brazil

Palavras-chave: Daucus carota; Herdabilidade; Parâmetros genético; Correlações; Cultivo de verão.

Ano: 2006

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362006000300019

Alves,Lânia Isis F.; Lima,Saulo Antônio A.; Felix,Leonardo P..

The chromosomes of 15 species of Iridaceae of the genera Alophia, Cipura, Eleutherine, Neomarica and Trimezia (subfamily Iridoideae) were examined after conventional Giemsa staining. The karyotypes of Alophia drummondii (2n = 14+1B, 28, 42 and 56), Cipura paludosa (2n = 14), C. xanthomelas (2n = 28) and Eleutherine bulbosa (2n = 12) were asymmetric; Neomarica candida, N. caerulea, N. humilis, N. glauca, N. gracilis, N. northiana and Neomarica sp. (2n = 18); N. cf. paradoxa (2n = 28), Trimezia fosteriana (2n = 52), T. martinicensis (2n = 54) and T. connata (2n = 82) were all generally symmetric. New diploid numbers of 2n = 56 for Alophia drummondii, 2n = 18 for N. candida, N. humilis, N. glauca, and N. gracilis, 2n = 28 for N. cf. paradoxa, and 2n = 82 for...

A novel c.1037C > G (p.Ala346Gly) mutation in TP63 as cause of the ectrodactyly-ectodermal dysplasia and cleft lip/palate (EEC) syndrome

Palavras-chave: Iridaceae; Disploidy; Karyotypic evolution; Polyploidy; Asymmetrical karyotype.

Ano: 2011

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572011000200016

Alves,Leandro Ucela; Pardono,Eliete; Otto,Paulo A.; Mingroni Netto,Regina Célia.

Ectrodactyly – ectodermal dysplasia and cleft lip/palate (EEC) syndrome (OMIM 604292) is a rare disorder determined by mutations in the TP63 gene. Most cases of EEC syndrome are associated to mutations in the DNA binding domain (DBD) region of the p63 protein. Here we report on a three-generation Brazilian family with three individuals (mother, son and grandfather) affected by EEC syndrome, determined by a novel mutation c.1037C > G (p.Ala346Gly). The disorder in this family exhibits a broad spectrum of phenotypes: two individuals were personally examined, one presenting the complete constellation of EEC syndrome manifestations and the other presenting an intermediate phenotype; the third affected, a deceased individual not examined personally and...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/report

Palavras-chave: EEC syndrome; TP63-mutations; P63-associated disorders; SHFM.

Ano: 2015

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572015000100037

Boundaries in metagenomic screenings using lacZα-based vectors

Alves,Luana de Fátima; Borelli,Tiago Cabral; Westmann,Cauã Antunes; Silva-Rocha,Rafael; Guazzaroni,María-Eugenia.

Abstract Metagenomics approaches have been of high relevance for providing enzymes used in diverse industrial applications. In the current study, we have focused on the prospection of protease and glycosyl hydrolase activities from a soil sample by using the lacZα -based plasmid pSEVA232. For this, we used a functional screen based on skimmed milk agar and a pH indicator dye for detection of both enzymes, as previously reported in literature. Although we effectively identified positive clones in the screenings, subsequent experiments revealed that this phenotype was not because of the hydrolytic activity encoded in the metagenomic fragments, but rather due to the insertion of small metagenomic DNA fragments in frame within the coding region of the lacZ...

Genetic divergence among populations and accessions of the spineless peach palm from Pampa Hermosa landrace used in the heart-of-palm agribusiness in Brazil

Palavras-chave: Functional metagenomics; Protease; Glycosyl hydrolase; False positive clones.

Ano: 2020

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572020000100803

Alves-Pereira,Alessandro; Clement,Charles R.; Picanço-Rodrigues,Doriane.

Although originally domesticated for its fruit, exploitation of the peach palm (Bactris gasipaes Kunth) in the production of gourmet heart-of-palm has also become an important activity, hence the need for improved material for large-scale production, on employing the Pampa Hermosa landrace as the seed source. In this study 11 microsatellite markers were used to evaluate genetic divergence among 96 elite plants representing four populations of spineless peach palm from the above cited source. Genetic variability was high (H T = 0.82). The low levels of divergence [F ST (0.023), G ST' (0.005)] and the high number of migrants (Nm -3.8 to 52.2) indicated significant interpopulation gene flow. Some of the plants presented high levels of genetic divergence, but...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/other

Palavras-chave: Bactris gasipaes; Heart-of-palm; Microsatellites; Genetic divergence; Genetic improvement.

Ano: 2012

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000300015

High genetic diversity among and within bitter manioc varieties cultivated in different soil types in Central Amazonia

Alves-Pereira,Alessandro; Peroni,Nivaldo; Cavallari,Marcelo Mattos; Lemes,Maristerra R.; Zucchi,Maria Imaculada; Clement,Charles R..

Abstract Although manioc is well adapted to nutrient-poor Oxisols of Amazonia, ethnobotanical observations show that bitter manioc is also frequently cultivated in the highly fertile soils of the floodplains and Amazonian dark earths (ADE) along the middle Madeira River. Because different sets of varieties are grown in each soil type, and there are agronomic similarities between ADE and floodplain varieties, it was hypothesized that varieties grown in ADE and floodplain were more closely related to each other than either is to varieties grown in Oxisols. We tested this hypothesis evaluating the intra-varietal genetic diversity and the genetic relationships among manioc varieties commonly cultivated in Oxisols, ADE and floodplain soils. Genetic results did...

Disseminação do melhoramento genético em bovinos de corte

Palavras-chave: Manihot esculenta; Microsatellites; Amazonian dark earths; Floodplain; Oxisols.

Ano: 2017

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000300468

R. Bras. Zootec.

Alves,Rafael Geraldo de Oliveira; Silva,Luiz Otávio Campos da; Euclides Filho,Kepler; Figueiredo,Geraldo Ramos de.

O esforço de produtores, pesquisadores e técnicos em geral, quanto ao melhoramento genético de bovino de corte, tem se concentrado fundamentalmente na avaliação, identificação e seleção dos reprodutores, e pouca atenção tem sido dada à disseminação desse material genético selecionado por intermédio do rebanho como um todo. A baixa taxa anual de mudança genética nos rebanhos pode ser, entre outras causas, indicativo de que, a despeito do sucesso isolado de alguns produtores em promover o melhoramento, a disseminação é feita de forma desordenada, fazendo com que o ganho genético obtido por alguns seja anulado pelo retrocesso de outros. Neste trabalho, a base teórica da disseminação do melhoramento genético em bovino de corte...